Подчинялись наземному (армейскому) командованию и не подчинялись командованию ВВС.
Касательно положения на 22 июня 1941 - подавляющее большинство самолетов этих КАЭ (в основном Р-5 и У-2) сгорело на аэродромах, эскадрильи были расформированы. По состоянию на июль-август в составе ВВС каждого фронта оставалось по одной-две АЭ на Р-5 (не считая РАЭ).
